شاید مشهورترین مورد متهم به اجرای سناریوی پرچم دروغین، حملات ۱۱ سپتامبر به برجهای دوقلوی مرکز تجارت جهانی در امریکا و آغاز لشکرکشی ارتش امریکا به افغانستان و عراق باشد.